吴集镇机关设“六办三中心一站所一大队”，分别为：

（一）六办：党政综合办公室、经济发展办公室、社会事务办公室、自然资源和生态环境办公室、社会治安综合治理和应急管理办公室、基层党建工作办公室。

（二）三中心：社会事业综合服务中心、农业综合服务中心、政务服务中心。

（三）一站所：退役军人服务站。

（四）一大队：综合行政执法大队。