衡东县医疗保障局于2019年3月22日正式挂牌成立，为县政府正科级工作部门。整合了县人社局的职工医保、城乡居民医保、生育保险职责，县发改局的药品和医疗服务价格管理职责，县民政局的医疗救助职责，县卫健局的药械集中采购和监督管理职责。局机关核定行政编制8名，内设办公室、计划财务股、政策法规股、待遇保障股、医药和医疗服务价格管理股、基金监管股、政工人事股7个股室。下设“衡东县医疗保障事务中心”一个二级机构，为副科级公益一类事业单位，负责全县基本医疗保险、生育保险、医疗救助等事务性工作，核定全额事业编制75名，内设办公室、财务股、内控股、信息技术股、参保登记股、职工医保待遇审核股、第一至第三居民医保待遇审核股、门诊医疗管理股、生育保险股、异地就医结算股、医疗救助股、定点协议服务股、健康扶贫股15个股室。